信号分子是植物体内的一些化学分子，它们的作用是在细胞内或细胞间传递信息。一般情况下，将细胞外的信号分子称为“第一信使”，如植物激素等。在细胞内传导信号的称为“第二信使”，如cAMP，cGMP，IP3，Ca2+等。根据信号分子的溶解性，可分为亲水性和亲脂性。信号分子的主要特点是特异性，高效性，可被灭活。信号分子有很多种类，包括蛋白质，氨基酸衍生物，胆固醇，脂肪酸衍生物等。

检测方法，主要包括化学分析、电化学等。

1.化学分析

首先，要从植物样品中将信号分子提取出来。利用信号分子的化学性质，比如非极性的信号分子，用正己烷，石油醚等溶剂；极性的信号分子，用乙酸乙酯，醇等溶剂。分离的方法有气相色谱，液相色谱，电泳，质谱等。根据信号分子的物理性质，比如分配系数，吸附，渗透等能力不同而分离。电泳方法，也可以根据电荷和分子量进行分离。LC-MS可以对化合物进行更准确的检测，确定其化学结构和分子量。

例如，HPLC测信号分子含量。样品制备包括研磨、提取、离心等步骤。色谱条件包括，常用的C18反相色谱柱，柱温在25-35℃。以乙腈，甲醇和水为流动相，有的还会添加缓冲液，比如乙腈和水，并加入一定的冰醋酸，流速为1.0ml/min。紫外检测器，波长根据化合物的性质，选择比较适合目标物质的吸收波长。

2.电化学

电化学方法是基于电化学反应的检测技术，通过测量电化学反应过程中产生的电位变化，来检测信号分子。当植物内发生氧化还原反应，信号分子会携带电荷，忙碌着传递信号。测定反应过程中的电流变化，可以测定中信号的浓度。当植物受到胁迫的时候，会有过氧化氢，一氧化氮的变化，通过电极传感器来测定含量。

3.电泳法

SDS是一种阴离子去污剂，能够将分子内或分子间的氢键断裂，使分子折叠起来，破坏蛋白质分子的二级，三级结构。还原剂如β-巯基乙醇，能够让半胱氨酸残基之间的二硫键断裂。在样品加入SDS和还原剂，样品中的蛋白质分子的氢键和二硫键发生断裂，蛋白质的氨基酸侧链会和SDS结合，形成带负电的蛋白质-SDS胶束。这个结合体所带电荷就比蛋白质原有的电荷量大，消除了蛋白质的自身的电荷影响，就看分子量大小。利用电泳的方法，根据梯度的标准分子量蛋白的迁移率，能够分离出来，结合标准曲线，计算出样品中蛋白分子量。

操作步骤，包括分离胶制备，样品制备，点样，电泳，固定，染色，脱色等。