微生物量碳是指体积<5000μm3活的和死的微生物体内碳的总和。它是土壤有机质中活性较高的部分，直接参与了土壤生物化学转化过程，增强了土壤的养分。它反应了土壤易于利用的养分，与土壤中的C、N、P、S等养分循环密切相关，是土壤活性大小的标志，也是土壤肥力检测的重要指标之一。

检测土壤中的微生物量碳的方法有许多，其中包括呼吸法、标记法、浸提法、氯仿熏蒸法等。

1.呼吸法

呼吸法是通过测定土壤中微生物呼吸释放出来的二氧化碳的量，间接的估算出来土壤微生物量碳。因为在微生物代谢的过程中，产生的二氧化碳含量是和生物量碳成一定的线性关系，可以采用动态或静态的方法来测定。也可以用二氧化碳吸收剂，比如氢氧化钠或氢氧化钠-碳酸氢钠混合物，将产生的二氧化碳吸收掉，并通过浸润试剂的吸收值来计算微生物量碳的含量。

2.标记法

通过标记的同位素技术测定土壤微生物生物量碳，常用的标记同位素是13C和14C。通过给土壤样品添加同位素标记物并追踪其在土壤中的分布和转化，可以计算微生物生物量碳。也可以采用生物标记法，也就是通过向微生物培养基中加入标记物，比如3H脱氧葡萄糖，测定这个东西在微生物活动过程中的代谢和转化情况，并最终得出微生物量碳的含量。

3.浸提法

利用氟化钠的氟离子抑制土壤微生物酶活性，从而测定微生物量碳含量。向土壤样本中添加一定浓度的氟化钠溶液，振荡混合后，将样本放置在高速离心机上，分离土壤颗粒和液相，测土壤微生物碳的干重。

4.氯仿蒸腾法

氯仿熏蒸能够破坏土壤微生物的细胞膜，导致细胞内容物释放到土壤中。通过测定浸提物中全碳的含量，来计算出样品中微生物量碳的含量。