色氨酸是人体必需的氨基酸之一，又称为β-吲哚基丙氨酸，是一种有机化合物，化学式C11H12N2O2。在植物体内普遍存在，色氨酸是生长素合成的前体物质。色氨酸有3中异构体：左旋，右旋，消旋。色氨酸通过肠上皮从食物中获取吸收，然后进入血液。血液中的大多数Trp与白蛋白结合，少量保持游离状态。

代谢途径主要包括三个主要方向：血清素途径、犬尿氨酸途径和吲哚类途径。

其中，色氨酸生成生长素的路线。1.色氨酸氧化脱氨形成吲哚丙酮，再脱羧形成吲哚乙醛。吲哚乙醛在相应酶的催化作用下，最终氧化生成吲哚乙酸。2.色氨酸先脱羧形成色胺，色胺再氧化脱氨形成吲哚乙醛，在酶的作用下氧化成吲哚乙酸。3.色氨酸先脱氨，生成吲哚乳酸。再脱羧形成色胺，继续氧化成吲哚乙醛，在酶作用下生成吲哚乙酸。

血清素途径：通过色氨酸羟化酶的作用，将色氨酸转化为5-羟色氨酸。再通过芳香族氨基酸脱羧酶的作用，将5-羟色氨酸转化为 5-羟色胺（5-HT）。

犬尿氨酸途径：发生在肝脏中，色氨酸被降解为多种生物活性化合物。代谢物包括犬尿氨酸、犬尿喹啉酸、喹啉酸、吡啶甲酸、朱砂精酸、黄尿酸等。

色氨酸靶向代谢组学检测方法，如气相色谱质谱联用（GC-MS）、液相色谱质谱联用（LC-MS）等，定量测定色氨酸代谢过程中的酶活及产物的变化。