色氨酸的代谢产物主要包括5-羟色胺（5-HT），烟酸（维生素B3），犬尿氨酸及衍生物，褪黑素，吲哚类衍生物（吲哚-3-丙酸，吲哚-3-乙酸等）。其中，5-HT是色氨酸经过色氨酸羧化酶催化生成5-羟色氨酸，再脱羧而形成的。烟酸是色氨酸由犬尿氨酸途径转化而来的，褪黑素是5-HT经过乙酰化和甲基化而生成的，肠道菌群可将色氨酸转化为吲哚-3-丙酸等吲哚类衍生物。

以吲哚-3-丙酸为例，可简称为吲哚丙酸，一般是采用高效液相色谱（HPLC）或液相色谱质谱（LC-MS）测定含量的。

吲哚丙酸是由1个吲哚环和1个丙酸基团组成的，吲哚环能让它具有反应活性，丙酸基团让它有了酸性和一些特定的化学性质。化学式为C11H11NO2，微溶于水，易溶于有机溶剂如乙醇，乙醚，氯仿等。以HPLC为例，简单的介绍一下测定过程。

1.样品处理

将植物组织样本进行粉碎和研磨，采用适合的有机溶剂如甲醇，乙腈等，并采取超声，离心，过滤等一系列的提取操作。比如，0.45um膜过滤，待测。

2.色谱条件

一般采用C18的色谱柱，250mm长，4.6mm内径，5um粒径；柱温25-30℃。用甲醇和水或乙腈和水为流动相，根据出峰情况调整流动相比例。流速1ml/min，进样量10uL，紫外检测器，波长280nm。仅供参考。

3.标准曲线

将吲哚丙酸的标准品用甲醇溶解，并梯度稀释5-7个浓度点。一般最低点为定量限，信噪比（S/N）的10倍，最高点要覆盖到样本溶液可能得范围。调整好仪器设备参数，稳定好状态，依次进样HPLC，测出色谱峰。记录它的保留时间和峰面积，通过峰面积和对应浓度的关系，拟合出标准曲线，得到回归方程。为了确保线性的准确性，相关系数R2要大于0.999，越接近1越好。

4.样品测定

进样HPLC中，得到色谱图，根据保留时间识别出目标色谱峰。对它的面积进行积分，代入到回归方程，计算出样品溶液中的吲哚丙酸含量。这个只是粉碎，研磨，超声，离心，过滤之后的溶液中的含量。如果要知道样品中的含量，还需要根据稀释倍数，逐步还原到样本组织时候的含量。这个一般是有公式计算出来的。